Điều 3 Luật tổ chức Quốc hội quy định: Quốc hội tổ chức và hoạt động theo nguyên tắc tập trung dân chủ làm việc theo chế độ hội nghị và quyết định theo đa số. Hiệu quả hoạt động của Quốc hội được bảo đảm bằng hiệu quả của các kỳ họp Quốc hội, hoạt động của Ủy ban thường vụ Quốc hội, Hội đồng Dân tộc và các Ủy ban của Quốc hội, các Đoàn đại biểu Quốc hội và các Đại biểu Quốc hội.

Các cơ quan của Quốc hội gồm có:

• Ủy ban thường vụ Quốc hội
• Văn phòng Quốc hội
• Hội đồng Dân tộc
• Ủy ban Pháp luật
• Ủy ban Tư pháp
• Ủy ban Kinh tế
• Ủy ban Tài chính, Ngân sách
• Ủy ban Quốc phòng và An ninh
• Ủy ban Văn hóa, Giáo dục, Thanh niên, Thiếu niên và Nhi đồng
• Ủy ban về các Vấn đề Xã hội
• Ủy ban Khoa học, Công nghệ và Môi trường
• Ủy ban Đối ngoại
• Viện Nghiên cứu lập pháp

Hội đồng Dân tộc và các Ủy ban của Quốc hội là các cơ quan của Quốc hội Quốc hội quyết định số lượng Ủy ban và bầu các thành viên của Hội đồng Dân tộc và các Ủy ban của Quốc hội. Khi xét thấy cần thiết, Quốc hội thành lập Ủy ban lâm thời để nghiên cứu, thẩm tra một dự án hoặc điều tra một vấn đề nhất định.

Một vấn đề liên quan đến sự độc lập Quốc hội và chức năng chấp hành là cơ cấu giữa Quốc hội và Đảng Cộng sản Việt Nam. Theo giáo sư và cựu đại biểu Nguyễn Minh Thuyết thì mọi việc đã do Trung ương Đảng Cộng sản quyết định rồi, nên Quốc hội bị hạn chế không có toàn quyền suy xét nghị luận. Hơn nữa vì đại đa số Đại biểu Quốc hội là đảng viên nên cũng không thể làm trái với nghị quyết của Trung ương Đảng.[27]

Sơ đồ tổ chức Quốc hội trong hệ thống chính trị Việt Nam